所以，大部份歷史學家都認爲，如果魏忠賢不死，大明還不會那麼快滅亡。
第二件事情就是整頓兵馬。
此時，大明已經陸續收集整合了共有七十多萬兵馬，其中三十多萬駐守在各州城之中。還剩約四十多萬可以支配調動。
牛仁將這四十多萬兵馬分撥如下：
前後左右中五軍都督各掌五萬兵馬，還有十多萬兵馬由左良玉這個兵部尚書帶領鎮守南京，隨時調遣支援各部。
軍事編制調整如下：
最低級士官爲伍長，帶五個士兵，往上一級是隊長，手下共有五個伍長，總共約爲三十多人。
然後再往上是小旗，手下共有三個隊長，總兵數爲一百左右。
再上一級是總旗，手下共有三個小旗，總兵數爲三百多人。
再上一級是遊擊將軍，手下共有三個總旗，總兵力約爲一千左右。
再上一級是參將，手下共有四個遊擊將軍，總兵力約爲五千人。
五千人爲一個營，參將擔任全營最高指揮官。
參將之上就是總兵，總兵沒有固定統領多少個營，最多的總兵有五個營，總兵力達到兩萬以上。
最少的總兵只有兩個營，總兵力才一萬左右。
總兵之上便是五軍都督了。
其次就是兵馬調派了。
牛仁命左軍都督李佔春率本部五萬兵馬駐守西南，以防張獻忠。
雖然牛仁已派出使者去和張獻忠結成戰略聯盟，但也不得不留有後手，以防萬一。
命後軍都督於大海率本部五萬兵馬駐守東南，穩住大明後方，招撫鄭芝龍等部。
命中軍都督曾英率本部五萬兵馬進駐楊州，加固城牆，屯積糧草，隨時備戰。
命前軍都督王祥率本部五萬兵馬駐紮在楊州淮河岸邊，打造船隻，操練水師，防範清軍渡河南下。
命右軍都督楊展的五萬兵馬帶兵繞道山西，準備隨進配合張獻忠的部隊從山西攻入北方。
一切調遣安排妥當，牛仁便靜等時局變化。
一個月之後，探子傳來吳三桂投降清夷，引清軍入關的消息。
兩個月之後，傳來北京城被清軍攻破，李自成率部逃往河南陝西一帶，集結兵馬，準備奪回北京。
三個月之後，禮部尚書出使大西歸來，帶回來令大明上下振奮的消息！
張獻忠同意與大明結爲軍事同盟，共同抵抗清軍!
雖然張獻忠之個人不太可靠，但至少是暫時穩住了西南局勢，避免了兩線作戰的危機。
張獻忠就算再怎麼反覆無常，他此刻也決不會背叛大軍，幫着清軍來捅大明的刀子。
再怎麼說，大明與大西都是大漢政權，此時外夷入侵，自然會抱團取暖，共同對外抗敵。
五個月之後，李自成的大順軍被清軍全面擊敗，率幾萬殘部逃往湖北，至此，中原北方已盡入清軍之手。
直到此時，文武大臣方纔明白半年前牛仁的一切調動是多麼的有先見之明！
不愧是洪武太祖皇帝啊！果然一切都料事如神，運籌帷幄之中！
又是一個月之後，探子傳來消息，多鐸率領十萬清軍分兵兩路從亳州和徐州兩路殺往楊州方向而來。
多鐸是努爾哈赤的第十五個兒子，也是多爾袞的同母弟弟，滿州鑲白旗旗主，清初八大****之一，也是清初名將之一。
消息傳到南京，頓時引起極大的震動！
關於這位多鐸，大明文武百官是早有耳聞，李自成幾乎就是被他給打殘的。
如果不是有牛仁這個假冒的太祖皇帝坐鎮在此，估計此刻南明的文武百官就不是震動，而是震驚加恐慌了！
奉天大殿內，牛仁高坐在龍椅正中，而崇禎則坐在龍椅一側。
“清夷多鐸率十萬鐵蹄南下，目標直取楊州，不知諸位愛卿對此有何看法？”
史可法首先出列道：“太祖陛下，楊州乃南京之屏障，若楊州失守，則南京危矣，故楊州保衛戰事關大明之安危，切莫掉以輕心。”
牛仁頻頻點頭，心中暗道：這以前的歷史就是史可法這位鐵骨錚錚的民族英雄，帶領大明將士和楊州百姓共同抵禦清兵侵略者。
只可惜手下幾個部將貪生怕死，率部投降多鐸，而南京方面卻又一直沒有派出援軍來支援史可法，這才導致了楊州城破，屠城十日的歷史慘劇！
今日，他牛仁穿越到此，就決不會再讓這個悲劇重來，他要讓女真蠻夷嚐嚐大明將士的真正實力！
禮部尚書出列道：“幸好太祖陛下料事如神，半年之前就已經調派了中軍都督曾大人率五萬兵馬在楊州屯糧築城，又調派右軍都督楊大人帶五萬兵馬駐所楊州淮河岸邊，打造戰船，操練水師，防範清夷，有這兩路共計十萬兵馬駐守在楊州，相信楊州必定固若金湯。”
滿朝文武大臣紛紛咐和，免不了又是對牛仁這個太祖陛下大吹特捧了一番。
在這些文武大臣以及大明所有將士和百姓心中，牛仁這個太祖皇帝就是他們的精神支柱！
他們都堅信，只要牛仁這個太祖轉世的人坐鎮南京，清軍就休想進犯一步。
待滿殿的文武大臣們拍完馬屁之後，牛仁便宣佈了一個重大決定！
“本太祖決定，要御駕親征，前往楊州指揮作戰，淮河將是這十萬來犯清夷的葬身之處！”
霸氣！
衆文武大臣全都跪倒在地，激動萬分，三呼萬歲！
整個奉天大殿中，都充滿了激情和鬥志！
五天之後，牛仁從鎮守南京的十萬禁軍中挑出三萬精兵，其中步兵兩萬五，騎兵五千，浩浩蕩蕩的向楊州出發。
南京離楊州不過兩百來裏，牛仁率大軍兩日便已到達楊州。
牛仁到達楊州之後，第一件事就是視察駐紮在淮河邊上的大明水軍。
這支大明水軍就是牛仁早在半年前調派的前軍都督李佔春的五萬兵馬。
當牛仁帶着幾百名親衛隊騎馬來到淮河大明水軍寨時，李佔春帶着數十名將領及幾萬水軍在淮河邊上叩頭迎接牛仁。
“臣李佔春恭迎太祖陛下！”
“恭迎太祖陛下！”衆將齊聲高呼！
“恭迎太祖陛下！”五萬大明水軍齊聲高呼，聲震雲霄，士氣如虹！
牛仁坐在駿馬之上環視了這幾萬明軍將士，運足真氣大喊道：“諸位將士辛苦了！全都平身吧！”
雖然只有一個人發出的聲音，但在這空曠的淮水邊上卻傳播極遠，讓這幾萬名明軍每個人都聽得清清楚楚。
“謝太祖陛下！”五萬明軍將士齊聲高呼，隨後整齊如一的站起身來。
看着這些精氣神充足的五萬明軍，牛仁不由滿意的點頭微笑。
不說別的，就從剛纔這五萬明軍整齊劃一的動作來看，牛仁就知道這半年來，前軍都督李佔春對這五萬軍士平時訓練必定嚴格。
再從這五萬將士那飽滿的精神來看，可見他們面對多鐸帶領的十萬清軍的即將攻來，並沒有表現出任何的恐懼，反而是鬥志昂揚！
兩軍交戰，士氣極爲重要！
想想歷史中的楊州保衛戰，大明將士面對多鐸帶領這十萬如狼似虎的清軍攻來，全都士氣渙散，根本無心戀戰，史可法的幾員部將甚至直接率部打開城門，投降清軍。
回想起這段令華夏兒女痛心的歷史，牛仁也不由扼腕嘆息！
如今，這段歷史再度重來，然而局面卻是截然不同！