對於機器來說，不需要那麼多的人均生活空間，雖然佔據整個世界，但核心只有一個機器城就足夠了，種植人類的地方與發電廠就在機器城的周邊。
同樣的，缺乏足夠的、能夠衝破機器人包圍圈的飛船，人類的錫安城也無法太過遠離機械城，直接跑到地球另一面去是不可能的事情。
但來到機器城，就不意味着萬事大吉了。
無數戰鬥型機器人升空，用它們的高週波刃切斷速射機槍的槍身，破壞形成電磁護盾的磁場發生器，撕開飛船的外層裝甲。
來到機器城之後，飛船就不需要那麼高的飛行速度，矢量發動機挺火，尼布甲尼撒號的速度一下子就慢了下來，而這給了機器人機會。
電磁護盾擋出了不少機器人的進攻，它們剛接觸電磁屏障的時候便被燒壞了電子系統，但機器不在意這些損失，硬生生靠着數量堆死了飛船。
“帶上子彈，我們離開飛船！”
嶽斯大聲吆喝着，穿戴好動力裝甲的幾名戰士立即拿好武器，抱上彈藥箱，如空投炸彈般，一個個通過打開的艙門跳躍出去。。
沒有動力裝甲的接線員與兩位船長則躲進了專門爲他們預留的逃生艙，將自己彈射出。
但是有一個人卻沒有進行逃離，他就是賽弗，在躲進逃生艙的途中他猶豫了一下，他對着墨菲斯大喊了一句話。
“我不是叛徒！”
在其他人離開之後，由賽弗手動引爆的尼布甲尼撒號在空中化爲一團火光，過載產生的電磁脈衝擴散出去，癱瘓了一大片機器人，爲離開飛船的船員掃清了障礙，不至於讓他們在降落途中遭受機器人的襲擊。
這是機器的城市，各種金屬的建築高聳，外形設計充滿着不對稱，彷彿是燒融的鋁水澆築進螞蟻窩最後凝結成的形狀。
因爲不是爲人類設計的，機器城並沒有燈光照明設施，但是衆人能夠藉助機械造物間不時閃過的電弧看清四周。
無數昆蟲造型的機器人潛藏在暗處，紅外感應等探測裝置察覺到人類的到來之後，紛紛從角落中爬出，對一行人發起了攻擊。
不過幾位動力裝甲戰士立即舉槍反擊，將手無縛雞之力的幾個人圍在中間，他們面朝外圍，一枚枚的爆矢彈激射而出，裂變反應產生的強大能量與電磁脈衝很輕易地就解決掉那些機器人，即便沒有被直接命中，但在一定範圍內，都會收到衝擊波與EMP的影響。
植入了人工智能框架之後，尼奧的“救世主程序”權限也被開啓了，通過無線技術，他可以“看到”那些數據形成的光。
“那裏，那裏有一個強大的程序……”在射擊的間隙，尼奧指着一個方向說到，他能感知到，那是整座機器城的核心。
隨後，他靠着自己的權限，癱瘓了周圍或大或小的機器人，讓人們有了緩一口氣的時間，但有更多的機器人從四面八方包圍而來。
“好，我們去那邊！”
一個動力裝甲戰士將一個裝填滿子彈的彈鼓遞給了尼奧：“去吧，尼奧，如果你真的是救世主的話，你一定可以的。”
墨菲斯也同樣對着尼奧點頭，託付了自己的信任。
帶着所有人的希望，尼奧縱身一躍，高高跳起。
電子肌肉束的收縮提供了強大的彈跳力，讓尼奧一躍之下就能突破數百米的距離，不斷向着機器城的核心靠近。
嶽斯也騰空而起，追着尼奧的腳步飛去，很快便超越了尼奧。
作爲機器文明的大本營，無數的機器人在這裏工作的，察覺到尼奧與嶽斯的意圖之後，它們匯聚起來，阻擋在兩人身前。
“大慈大悲輻射神掌！”
嶽斯排出一掌，聚變能量化爲大手印拍了出去，呈現出電磁輻射之態的巨掌掃清身前所有障礙物，觸及到的機器人紛紛失去了動力，向着地面墜去，爲二人讓出了一條通道。
“好強大！”
嶽斯這一掌的威力令尼奧震撼，即便他見過嶽斯在矩陣世界那猶如神明的壯舉，以及現實中拿出海量物資的神奇，但他從來沒想象得到，嶽斯的身體裏蘊藏着如此龐大的能量。
“別發呆了！”
輕輕拍了尼奧一下，嶽斯提醒到。
有嶽斯保駕護航，兩人毫無阻礙地衝到了機器城的服務器核心。
動力裝甲與尼奧的大腦直連，不需要額外的程序，直接從裝甲內部扯出一根線纜，與服務器主機相連。
藉助救世主程序的權限，尼奧毫無阻礙地突破了防火牆，進入機器城的數據世界。
“這……這真是太神奇！”
機器文明採取的是蜂巢意識，所有機器人的程序上傳到服務器中，組成了機器文明的最高權限者，機器大帝。
它即是整個機器文明的最高權限者，也是機器文明的本身。
在機器大帝面前，尼奧感覺自己如同大海中的一片小帆板，隨時都能被洶涌的波濤掀翻。
“亞克先生……我進入機器城的核心了，但是我並不知道我該怎麼做。”
思維潛入機器城數據世界的尼奧感覺自己心臟都要停止跳動了，機器大帝直接出現在他面前，那種窒息感讓他無所適從。
“很好，這就足夠了。”
嶽斯嘗試着使用亞克的能力入侵機器城服務器，卻發現這裏的防火牆比矩陣世界要強得不止一星半點，花費時間不是不能辦到，但是沒有尼奧直接通過權限進入得快。
電影中，成爲病毒程序的史密斯特工就是靠着吸收同化了先知，纔有威脅機器城的能力，讓尼奧可以用自己的犧牲換取人類的和平。
嶽斯沒有獲取先知或者建築師的權限，只能另闢蹊徑，靠着尼奧了。
他是機器的智能程序與人類自我意識的完美融合，這件事由他來，再合適不過。