且說晉哀帝不嗣位逾年，又改元興寧。太妃周氏，在琅琊第中壽終，帝出宮奔喪，命會稽王昱，總掌內外諸務。嗣因燕兵入寇滎陽，太守劉遠棄城東走，乃加徵西大將軍桓溫爲侍中大司馬，都督中外諸軍事，並假黃鉞。且命西中郎將袁真，都督司冀並三州軍事。北中郎將庾希，都督青州諸軍事。桓溫令王坦之爲長史，郗超爲參軍，王珣爲主簿。超多鬚，時人號爲髯參軍；珣身矮，時人號爲短主簿。嘗有歌謠雲：“髯參軍，短主簿，能令桓公喜，能令桓公怒。”溫嘗睥睨一切，予智自雄，惟謂超纔不可測，待遇甚厚。超亦深自結納，爲溫效忠。又有謝安兄子玄，亦爲溫掾屬，溫輒語左右道：“謝掾年至四十，擁旄仗節，王掾當作黑頭公，二人皆非凡才，前途正不可限量呢。”
越年，哀帝寢疾，復請褚太后臨朝攝政，拜溫爲揚州牧，使侍中顏旄，宣溫入朝參政。溫上表固辭，朝旨不許，再發使徵溫。溫乃啓行至赭圻，不料來了尚書車灌，止溫入都，無非說是“秦燕內侵，仍須賴公外鎮”云云。想是慮他權重難制，故使中止。溫不肯即還，便在赭圻築城，暫時駐節，遙領揚州牧。那哀帝因迷信方士，好餌金石，以致毒性沈痼，生就一種慢性症，一時不至遽死，亦不能復愈。遷延過了一年，已是興寧三年了，皇后王氏，卻得了暴病，驟致不起，因即棺殮治喪，追諡曰靖。上元令節，變作哀期，適燕太宰慕容恪，復擬取晉洛陽，先遣鎮南將軍慕容塵，攻陷許昌汝南諸郡，然後使司馬悅希駐盟津，豫州刺史孫興駐成皋，漸漸的進逼洛水。洛陽守將陳祐，檢閱部兵，不過二千，糧餉又不過數月，自知不能固守，不如引衆先走，遂借援許爲名，出城徑去，但留長史沈勁守洛陽。勁系王敦參軍沈充子，充受誅後，勁逃匿鄉里，年三十餘，不得入仕。吳興太守王胡之，受調爲司州刺史，特請免勁禁錮，起爲參軍。有詔依議。偏胡之忽嬰疾病，未得蒞鎮。勁獨上書自請，願至洛陽效力。晉廷乃命勁爲冠軍長史，使自募兵士，赴洛從軍。勁募得壯士千人，入洛助祐，前此得卻燕圍，勁力居多，至祐出城自行，將士多由祐帶去，只剩下五百人，隨勁留守。勁明知孤危，卻反欣然道：“我志在致命，今可償我初志了。”遂率五百人誓死守城。
那陳祐自洛陽出發，並未往許，竟奔趨新城。晉廷得報，即由會稽王昱，親赴赭圻，與大司馬桓溫議御燕事。溫乃移鎮姑孰，表薦右將軍桓豁監督荊州揚州的義城，及雍州的京兆諸軍事，振威將軍桓衝，監督江州荊州的江夏的隨郡，及豫州的汝南西陽新蔡潁川諸郡軍事。豁與衝俱系溫弟，溫雖是舉不避親，究竟有陰布羽翼，廣拓聲威的意思。直誅其心。會聞哀帝大漸，會稽王昱匆匆返都，及抵建康，哀帝已經升遐了。昱入見太后，與議嗣位事宜。哀帝無子，只好令哀帝弟奕，入承大統，當由
帝遂不救厥疾，艱禍仍臻，遺緒泯然，哀慟切心。琅琊王奕，明德茂親，屬當儲嗣，宜奉祖宗，纂承大統，俾速正大禮以寧人神，特此令知。
昱奉令出宮，頒示百官，當即迎奕入殿，纘承帝祚，頒詔大赦，奉葬哀帝於安平陵。哀帝崩時才二十五歲，在位只閱四年。晉廷喪君立君，方忙碌的了不得，那燕兵竟乘隙進攻洛陽，遂使壯士喪軀，園陵再陷，河洛一帶，復爲強虜所有了。言之慨然。
燕太宰慕容恪，探知洛陽兵寡，遂與吳王垂，率兵數萬，共攻洛陽。恪語諸將道：“卿等嘗患我不肯力攻，今洛陽城雖高大，守卒孤單，容易攻下，此番可努力進取，不必疑畏。倘或頓兵日久，敵得外援，恐反不能成功了。”緩攻廣固，急攻洛陽，慕容恪卻是知兵。諸將得了恪令，個個是摩拳擦掌，踊躍直前。一到洛陽城下，便四面猛撲，奮勇爭登。城中只有五百兵士，怎能擋得住數萬雄師守將沈勁，見危授命，明知城孤兵寡，當不可支，但一息尚存，不容少懈，因此登陴守禦，力拒燕軍。起初是備有矢石，擲射如注，就使燕軍志在拔幟，前仆後繼，究竟是血肉身軀，不能與矢石爭勝，所以攻了數日，那一座孤危萬狀的圍城，兀自保持得住。後來矢盡石空，守城無具，尚仗着一腔熱血，赤手空拳，與敵鏖鬥，待至糧食已盡，兵士飢疲，五百人喪亡一大半，眼見得勢窮力盡，不能再持。燕兵併力登城，城上不過一二百人，如何攔阻遂遭陷沒。勁尚引着殘卒，拚死巷鬥，畢竟雙拳不敵四手，被燕兵左右攢集，把他活捉了去，牽往見恪。恪勸勁降燕，勁神色自若，連說不降。恪暗暗稱奇，欲加寬宥。中軍將軍慕容度道：“勁雖奇士，看他志趣，終不肯爲我用，今若加宥，必爲後患。”恪乃將勁殺死，令左中郎將慕容築爲洛州刺史，鎮守金墉，留衛洛陽；自與吳王垂略定河南，直至崤澠，關中大震。秦王堅親率將士，出屯陝城，備禦燕軍。恪見秦有備，方收兵還鄴，惟使垂爲徵南大將軍，領荊州牧，都督荊揚洛徐兗豫雍益涼秦十州軍事，配兵一萬，駐守魯陽。晉廷始終不發一兵，往復河洛，但追贈沈勁爲東陽太守，聊旌忠節罷了。勁若有知，尚留餘恨。
是年七月，帝奕立妃庾氏爲皇后，後爲前荊江都督庾冰女，親上加親，當然乾坤合德，中外臚歡。只是帝奕後來被廢，歿無尊諡，歷史上但稱帝奕，小子不得不沿例相呼。特別提明。庾氏得列正宮，好象是預知廢立，不願久存。才閱十月，便安然歸天，予諡曰孝，當即奉葬。進會稽王昱爲丞相，錄尚書事，入朝不趨，贊拜不名，履劍上殿。是年，改元太和，算是帝奕嗣位的第一年。益州刺史周撫病歿，詔令撫子楚繼任。撫鎮益州三十餘年，甚有威惠，遠近讋服。梁州刺史司馬勳，久思據蜀，只因撫有威名，憚不敢發，及撫死楚繼，遂舉兵造反，自稱成都王，攻入劍閣，圍住成都。周楚遣使至下流告急，桓溫遣江夏相朱序往援，會同楚兵，內外夾攻，得將司馬勳擊斃，蜀地復平。序收兵東歸。
惟燕兵復屢寇晉境，燕撫軍將軍慕容厲寇兗州，連陷魯高平數郡。晉南陽督護趙億，舉宛城降燕。燕令南中郎將趙盤戍宛。越年初夏，燕鎮南將軍慕容塵，又寇晉竟陵，虧得晉太守羅崇，應變有方，出兵擊退燕軍，又與荊州刺史桓豁，合兵攻宛，走趙億，逐趙盤，奪還宛城，崇還戍竟陵。豁追趙盤至雉城，復殺敗盤兵，且將盤活擒歸來，燕人始稍稍奪氣，斂兵自固。並且燕室長城慕容恪，得病垂危，不能視事，所以境外軍務，暫從擱置，不復進兵。